一种改进的基因功能网络术语相似度计算方法 |
投稿时间:2018-09-30 点此下载全文 |
引用本文:唐智,刘志明,罗凌云,等.一种改进的基因功能网络术语相似度计算方法[J].医学信息学杂志,2019,40(2):47-52 |
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基金项目:国家自然科学基金“大型复杂医学领域本体质量评估理论研究”(项目编号:61502221);南华大学研究生科学基金项目“基于基因本体相似度计算算法研究”(项目编号:2018KY Y083);国家自然科学基金“面向资源型社交网站的知识图谱构建方法研究”(项目编号:61402220);湖南省哲学社会科学基金“面向新闻评论的网络舆情演化分析研究”(项目编号:16YBA323)。 |
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中文摘要:阐述现有基因术语间语义相似度计算方法,提出基于融合高斯核函数的重启随机游走的基因本体术语相似度算法(Random Walk with Restart-based Similarity Measure,RWRSM),测试算法性能并进行分析,结果表明该算法优于其他算法,可以提高准确性及稳定性。 |
中文关键词:基因功能网络 术语相似度 NETSIM2 随机游走 基因本体 |
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An Improved Similarity Calculation Method of Terminology of Gene Function Network |
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Abstract:The paper elaborates on the existing semantic similarity calculation methods between Gene Ontology(GO) terminologies, puts forward the Random Walk with Restart-based Similarity Measure (RWRSM) based on the Gauss Kernel Function, tests the performance of the calculation method and carries out analysis. The result shows that the calculation method is superior to any other calculation method since it increases the accuracy and stability. |
keywords:gene function network term similarity NETSIM2 random walk Gene Ontology(GO) |
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