医学知识图谱
2025, 46(7):40-44, 52.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2025.07.007
摘要: 目的/意义 构建多源知识图谱,提出基于知识图谱的药物发现方法,为疾病新药研发提供参考依据。方法/过程 设计知识图谱架构,优选7种异构数据库,经知识抽取、数据处理与清洗、知识融合构建知识图谱。基于图谱和SemMedDB建立推理规则及关联路径,改进加权链路预测方法,提出可用于药物发现的综合知识发现方法。结果/结论 以阿尔茨海默病为例,构建含67 780个实体、282 870个三元组的多源异构疾病知识图谱,预测潜在治疗药物184种。
2025, 46(2):22-28.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2025.02.004
摘要: 目的/意义 构建涵盖循证医学知识和电子病历数据的通用医学知识图谱,以提升图谱的应用效能。方法/过程 梳理多源异构数据情况,融合国内外知名知识图谱,设计图谱schema。利用RoBERTa预训练模型进行词嵌入,从医学文献、网络文献、教科书、医学数据库和电子病历等数据源中提取命名实体和关系,采用基于规则的SWIQA框架和基于随机抽样的人工审核策略评价图谱质量。结果/结论 共确定128个本体和1 108种关系,并以三元组形式存储于数据库中。经评估,图谱语义准确性达93.8%。所构建的通用医学知识图谱不仅涵盖循证医学知识,还包括临床真实世界产生的专家经验,为医学人工智能应用的进一步发展提供了有力支撑。
2024, 45(10):33-39.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.10.007
摘要: 将电子信息领域的知识图谱技术引入中药术语研究,以生动的方式展示中药治疗作用与性味归经和中医疾病之间的辨证关系。方法/过程 采用自上而下的本体构建方式在Protégé平台搭建中药本体顶层结构。以2020版《中国药典》一部为数据来源,抽取其中的中药信息,并整理各轴位信息、消歧和归一。借助Protégé平台创建实体和关系,以语义网络资源描述框架RDF数据格式输出中药三元组数据,并以Neo4j图数据库存储、展示,形成系统化的中药知识图谱。结果/结论 完成基于《中国药典》的中药知识图谱构建,可通过数据统计分析、知识计量以及可视化图形绘制,充分揭示中药领域复杂的知识系统结构。
2024, 45(9):96-101.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.09.016
摘要: 目的/意义 构建知识图谱型智能教学应用系统,为医学院校持续优化专业建设、提高医学及相关专业人才培养质量提供数据支撑。方法/过程 采用文献归纳法,系统梳理当前知识图谱应用于教学的进展,基于布鲁姆教学认知模型,结合学生学习情况及底层算法,构建知识图谱型智能教学应用系统。结果/结论 系统通过精准检测、内容推送及路径规划,形成动态闭环的教学反馈机制,有助于提升临床教师的精准教学能力,促进医学生个性化学习。
2024, 45(4):14-20, 51.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.04.003
摘要: 目的/意义 构建中成药说明书知识图谱,实现基于知识推理的智能推荐。方法/过程 基于Py2neo结合Neo4j图数据库搭建知识图谱的技术,整理1 380种中成药信息并构建数据库,基于三元闭包算法实现知识推理,运用概率模型计算中成药推荐评分。结果/结论 共形成实体概念11 103个,语义关系24种。构建了中成药智能推荐知识图谱,搭建中成药智能推荐平台实现中成药的准确推荐。实现中成药与知识图谱领域结合,为中医辅助诊疗提供方法借鉴,为进一步开展中成药知识可视化研究提供参考。
2024, 45(4):8-13.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.04.002
摘要: 目的/意义 将多模态知识图谱应用于围产保健继续医学教育,以提高医护人员围产保健服务质量。方法/过程 结合北京协和医院围产保健继续教育项目学员需求和课程主要特点构建顶层本体,对本体类、关系和属性进行设计和定义,利用不同粒度教学资源表示教学内容,利用Protégé软件构建围产保健知识图谱概念层和实例层。基于团队自主研发的医学知识服务平台MedKaaS,实现多模态实体进一步交互式构建,以及围产保健课程知识的可视化、检索和问答。结果/结论 该多模态知识图谱实现了围产保健课程内容的语义化整合,有助于学员直观和有针对性地学习围产保健知识。
2024, 45(4):1-7, 30.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.04.001
摘要: 目的/意义 探析知识服务系统中学术知识图谱的构建框架和方法,为开展基于科技大数据的新型知识服务提供参考。方法/过程 提出面向知识服务系统的学术知识图谱构建框架及方案,以医药卫生知识服务系统为例,详细阐述构建步骤及构建过程中的关键技术。结果/结论 基于多类型科技数据资源构建的学术知识图谱有助于更好地开展学术实体的关联挖掘与知识推理,提高科技数据组织管理效率,提供更高效的知识服务。
2024, 45(3):40-45.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.03.007
摘要: 目的/意义 调查不同群体对医疗健康知识图谱的需求,探讨知识图谱研究现状和不足,为医疗健康知识图谱的构建提出建议。方法/过程 基于文献调查、问卷调研、专家访谈等方式,从数据来源、关键技术、应用场景、待改进之处等方面分析医疗健康知识图谱。结果/结论 提出以国家政策为导向、以权威知识为依托,支持用户全程参与,注重个人隐私和知识产权保护,构建多场景、可视化、多语种、多模态的医疗健康知识图谱和易于知识传播的标准体系及底层数据规范制度。
2023, 44(12):65-70.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2023.12.011
摘要: 目的/意义 创建乳腺癌知识图谱的本体模型,实现乳腺癌知识的结构化表达和可视化展示。方法/过程 对乳腺癌知识进行抽取和表示,利用Protégé软件创建乳腺癌知识图谱本体模型。模型包含患者、患者基本信息、检查、诊断、检查实体属性值5类实体,以及具有、检查、诊断、属于等10余种关系。结果/结论 乳腺癌知识的图形化展示有助于提高公众对乳腺癌的关注和了解,对乳腺癌的预防与健康管理具有积极作用。
2024, 45(1):45-51.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2024.01.008
摘要: 目的/意义 综述生物医学领域基于知识图谱的知识发现方法,为科研人员提供参考。方法/过程 通过系统检索及阅读分析相关文献,总结基于知识图谱的知识发现方法,对比各类知识发现方法的优势和不足;指出现阶段生物医学领域基于知识图谱的知识发现方法的局限性和挑战,并提出建议和展望。结果/结论 未来研究应提升知识发现结果的可解释性,构建有效的结果评估框架,建立规范化、多领域专家协同的知识发现流程,提高知识发现研究的质量和效率。
2023, 44(8):42-48.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2023.08.008
摘要: 目的/意义 构建面向老年疾病康复的知识图谱,以探索预防、康复一体化的居家老年人自主管理体系,提高智能老年疾病康复和照护体系的个性化水平和效能,为应对人口老龄化提供助力。方法/过程 通过自然语言处理算法、医学专家人工标注构建面向老年疾病康复的知识图谱,使用Med-BERT + BiLSTM + CRF组合算法进行实体抽取,并搭建基于知识图谱的智能问答系统。结果/结论 新设计的面向老年疾病康复的知识图谱质量达到预期,基于知识图谱的问答系统能够为老年用户提供交互友好的知识获取方式。
2023, 44(2):35-41.
DOI: 10.3969/j.issn.1673-6036.2023.02.006
摘要: 介绍中医学症状研究及中医药领域知识图谱技术应用研究现状,选取《中医药学名词》作为症状知识来源,构建中医症状知识库。运用描述性统计、关联规则分析等数据挖掘方法阐述高频证型以及症状信息分布规律、症状以及症状隐性知识之间的关联关系,利用Neo4j构建中医症状知识图谱并分析病证-症状-属性之间的知识关联关系。
